堵胤锡又提出些关于调兵遣将的问题，比如抽调御营将士随同，以随时应对意外的突发事件，凡是他所请求的，朱由桦能答应的无不应允，堵胤锡最后说：“陛下不以臣卑微鄙陋，深负倚任，臣受恩深重，惟有鞠躬尽瘁以报陛下。然臣一离国门，消息传递便会有所滞怠，而军情瞬息万变，今日臣向陛下辞行，恳请陛下全力支持，允便宜行事，使臣能克竟全功。”
“整顿军务，地方军将有所反弹本是寻常。卿大可放心前去，一切由朕做主。”说到最后，朱由桦一改之前的温和神情，满含煞气的道：“江北防务关乎社稷存亡，整顿时必须施展雷霆手段，这样吧，朕给卿包括忠武镇在内的一万御营新军充作督师亲营，随卿一同入江北，地方军将若有反抗者，总兵以下，可先斩后奏！”
堵胤锡激动地跪下叩头道：“陛下如此信任，臣虽粉身不足为报。”
朱由桦面露欣喜之色的道：“卿能如此，朕还有何忧！所需一切，朕即谕各有司即日供办，愿卿此去江北，能早奏大功，朕在南京日夕盼望佳音。此外，朕还有一言送行，比宋之文天祥、本朝之于少保。爱卿可打开锦盒一观。”
堵胤锡又一次叩头谢恩，山呼万岁，用颤抖的双手打开锦盒，取出御制之言。旁边的小内监替他捧住锦盒。他将一卷正黄描金云龙蜡笺展开，上有朱由桦亲题字句，每字有两寸见方，后题“赐督师胤锡”五个字。蜡笺上盖有“朱由桦御笔”的篆体阳文朱印。堵胤锡颤声朗诵：“苟利国家生死以，岂因祸福避趋之。”
朗诵毕，堵胤锡一边拜，一边流泪，却哽咽得说不出一句话来。
赐过御言后，朱由桦一挥手，内监们退到一旁，他走到堵胤锡跟前，声调沉重地说：“江北局势糜烂日久，满是沉疴，削藩之成败，皆系于爱卿一身。目前官军将骄兵惰，爱卿此回江北，第一步在剪除奸逆，乱臣，继而以此整肃纪律，务必使三军将士不敢再视主帅如无物，以国法为儿戏，然后方可以显朝廷之威重，振疲弱之士气。”
“臣明白。”
朱由桦又道：“东虏大军不日将要南下，整肃削藩之时爱卿定要兼顾防务，修筑工事，部署兵力，预先谋定好攻守大计，志欲其坚，步欲其稳，二者兼顾，方为万全。至于其他详细安排，等爱卿到了江北后再说，祝爱卿一路顺风，马到成功！”
堵胤锡叩头谢恩后乃去。
就在他离开皇宫的同一时刻，午门外的广场上密密麻麻跪了一地的人，一个个都是垂头丧气，引颈待戮的样子。
其中就有黄宗羲、侯方域、左光先、顾杲这些东林复社的死硬造反派，还有一些就是在皇帝亲征在外与左良玉军激战时，趁机在南京城内煽风点火，鼓动人心的一些有东林复社背景的士子，他们都是二三十岁年纪的读书人，其中不少都有秀才的功名，甚至还有举人功名的。
朱由桦凯旋回京后，秋后算账，出动数千锦衣卫，不到两日，这些原本的漏网之鱼全被一一锁拿归案，一体抄家，革除功名，判处极刑。
午门广场外的四周满满当当的全是看热闹的城中百姓，看着那些昔日高高在上的书生老爷们，指指点点，还有一些特意被邀来观看的东林籍士绅朝官。
“查黄宗羲、侯方域、雷演祚、胡以轩、钱天成、陈贞慧等人，不仅胁从左逆图谋叛乱，且造谣蛊惑，诋毁天子，欺君罔上，今已核查清楚，着令全部处斩！”
刑部官员将判决书一字一顿的说完后，早已准备在一旁的侩子手，立刻拥奔上前，一把按住他们，然后齐刷刷地举起手中的鬼头大刀，纷纷大喝一声，便挥刀劈下，只见得一片血光迸溅，五六个大好头颅，当场便滚落到了广场上的砖石地上，喷撒出的鲜血，将青色的砖石染成一片血红。
侩子手们斩完一排，再接着斩下一排，跪在地上的那些还没被处斩的士子书生们，平日里左右乡里，什么诉讼，赋税、教育，基本上就是这些书生和他们所在的宗族左右着，一个普通儒生可以和县令叫板，干涉朝局，颐气指使惯了，原本只是想声援一下狱中的好友，何曾想过最后会是这等结局。
在最初色厉内荏的唾骂过后，此时大多已吓得瑟瑟发抖，不少人甚至大小便失禁了。对于他们的哀求讨饶声，侩子手们一概置之不理，只是一排排的斩过去。可怜侯方域，直到死前都不知道他最钟爱的小妾李香君的消息，到底是死了，还是活着，带着巨大的遗憾就到阎王那报道去了。
等罪犯们全部人头落地，四周百姓沉寂了片刻后，突然发出一阵惊天般的叫好声，纷纷拍手称快，唾骂这些人伪君子们死得活该。
也亏得阮大铖宣传工作做的到位，在行刑前就有大量的舆论造势了，运用他超凡的文笔，把那些东林伪君子的真面目毫不留情的揭露给了世人，邸报贴满了南京城的大街小巷。早已元气大伤的东林党们根本无力还击，南京城内的舆论几乎是一面倒了，全都在讨伐那些叛国的书生败类。
百姓们冒着寒雪天气前来围观，一直闹到夕阳西下的时候，才在卫士的疏导下乱哄哄的散去，被邀的剩余有东林复社背景的士绅们一个个脸色苍白，大冷的天都冒着虚汗，第一次感受到了帝王的威严不容侵犯。
大明自二祖以来，多少年没遇到手段如此酷烈的强势君主了，曾经让他们恨得牙痒痒的万历皇爷和这位主儿一比，都算难得的仁君了。这些日子，社友党友们如割麦子一般，被一批一批的斩杀，有的人憎恨、有的人不甘、但更多的还是庆幸，庆幸自己没有蹚这几潭浑水，庆幸自己当初的明智退让，庆幸自己和他们不是一路人。